
Библиотека «Истоки» находится в Заисточье – старом районе города. Когда-то через него въезжали в Томск путешественники. Хотя район называли татарской слободкой, население его было многонациональным. В XVII веке население слободки занималось торговлей, доставкой грузов и перевозкой людей на подводах. В Заисточье владели имуществом крупные томские купцы - Евграф Королёв и Калман Бенцианов Дистлер. Район был автономным мирком, где было все своё – бани, прачечные, фотосалоны, трактиры, лавки, мастерские, питейные заведения, постоялые дворы и своя библиотека.

Дом по адресу ул. М. Горького, 23, где теперь находится библиотека, историки относят к постройкам второй половины XIX века (примерно 1880 год). Первоначально в нём на первом этаже располагался магазин, на втором находились жилые помещения, а в подвалах предположительно были склады. В книге «История названия томских улиц» (2012) говорится о том, что в 1912 году в этом здании располагалась прачечная «Образцовая». В книге Л. В. Муравьёвой «Моя малая Родина» (2005) описано, что первая библиотека появилась на базе мусульманской библиотеки в 1927 году; именно этим годом датирован «Паспорт» об организации татарской библиотеки с книжным фондом в 200 экземпляров книг на арабском языке. Своих первых читателей библиотека встретила в помещении клуба «Нацмен» (сегодня это здание Красной мечети). Первой заведующей была Гемирьянова Рахима Кашафовна (c 1927 до 1964 года). После неё библиотекой долгое время заведовала Ненашева Вера Алексеевна (с 1964 до 1985 года).
С 1946 года библиотека становится русско-татарской, где фонд представлен уже на двух языках – русском и татарском.
В 50-х годах XX столетия весь библиотечный фонд на татарском языке был передан в дом культуры деревни Эушта, остались только русскоязычные книги.

С 1961 года библиотека становится городской библиотекой №5. А с 1998 года она вошла в состав Муниципальной информационной библиотечной системы и стала называться библиотекой «Истоки». Заведующими «Истоков» были Ненашева Вера Алексеевна (с 1964 до 1985 года), Тюменева Любовь Сергеевна (с 1985 до 2005 года), Озерова Елена Юрьевна (с 2005 до 2008 года), Грузинская Оксана Алексеевна (с 2009 года по настоящее время).

На сегодняшний день библиотека «Истоки» является культурно-досуговым центром микрорайона Заисток. В ней проводятся конкурсы, игровые программы, познавательные беседы для детей. Для старшего поколения работает клуб «Заисток», организованный совместно с Центром социальной поддержки населения Советского района. Библиотека активно сотрудничает с Администрацией Совесткого района, Детской художественной школой №1 и другими организациями. Её фонд содержит художественную и отраслевую литературу для детей и взрослых и насчитывает 16 тыс. экз., а читателями являются более 800 человек разных национальностей.